LNA的最佳替代物 — 2''-F-RNA，价格仅为LNA的1/2或更低-商家活动-资讯-生物在线

LNA的最佳替代物 — 2''-F-RNA，价格仅为LNA的1/2或更低

作者：北京赛百盛基因技术有限公司 2016-12-15T14:33 (访问量:5093)

LNA的最佳替代物 — 2'-F-RNA，价格仅为LNA的1/2或更低

　　由于各种各样的原因，需要对合成的寡核苷酸进行化学修饰：增加磷酸二酯键的稳定性、调整双链的稳定性、改变DNA或RNA构象，或者增加细胞摄取。这些修饰包括phosphorothioates、phosphorodithioates和phosphonoacetates。糖单元修饰一般被用作提高核酸酶抗性或者增加互补寡核苷酸靶向性。随着越来越多的非天然糖单体的商业化，糖基修饰的数量在不断增加。最早的商业化糖基修饰为2’-OMe analogue，该修饰提高了DNA和RNA抵抗核酸酶降解的稳定性以及提高了标靶分子的Tm值。
　　锁核苷酸(LNA) — 在日本称为bridged nucleic acid (BNA) — 用于探针或者siRNA的修饰，越来越受欢迎。但不幸的是，由于**方面的原因，我们不能提供LNA修饰，该技术被Exiqon公司所垄断。
　　目前可供选择的2’-fluoro RNA与LNA具有相同的特性，可作为一个合适的替代品。首先，引入2’-F-RNA修饰后的寡核苷酸可提高靶向分子的Tm值，掺入一个2’-F-RNA就可以使Tm提高约1-2°C。其次，含有2’-F RNA修饰的寡核苷酸可以抵抗核酸酶降解；无论体外还是体内，2’-F-RNA修饰的siRNAs比没有修饰的siRNAs更能抵抗酶降解。
　　含有2’-F RNA修饰的寡核苷酸已被用于反义寡核苷酸与siRNA寡核苷酸。RNA寡核苷酸甚至完全可以用2' 修饰 (2'-OMe 或2'-F)替代，保持在人体细胞内使基因表达沉默的能力，甚至相对于天然siRNA, 其效力表现出高达500倍的增长。另外，在aptamers以及antagomirs中，2’-F RNA修饰的寡核苷酸被证明是有活性且有益的，这些合成的寡核苷酸能够在体外与体内使micro-RNAs沉默。
　　因此，我们完全可以用2'-F-RNA代替LNA，且价格比LNA低很多。赛百盛公司2'-F-RNA合成的报价如下：

产量	单价（元/base）	出货时间
2 OD	200元/base	3-4工作日交货
5 OD	300元/base
10 OD	400元/base

参考文献

1. B.S. Sproat, A.I. Lamond, B. Beijer, P. Neuner, and U. Ryder, Nucleic Acids Res., 1989, 17, 3373.
2. T. Imanishi, and S. Obika, Chem Commun (Camb), 2002, 1653-1659.
3. S. Obika, Y. Hari, M. Sekiguchi, and T. Imanishi, Angew Chem Int Ed, 2001, 40, 2079-2081.
4. A.A. Koshkin, et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630.
5. M. Petersen, and J. Wengel, Trends Biotechnol, 2003, 21, 74-81.
6. A. Sabahi, J. Guidry, G.B. Inamati, M. Manoharan, and P. Wittung-Stafshede, Nucleic Acids Res., 2001, 29, 2163-2170.
7. T. Ono, M. Scalf, and L.M. Smith, Nucleic Acids Res., 1997, 25, 4581-4588.
8. P. Muhonen, et al., Chemistry & Biodiversity, 2007, 4, 858-873.
9. W. Guschlbauer, and K. Jankowski, Nucleic Acids Res., 1980, 8, 1421-1433.
10. K.R. Julien, M. Sumita, P.-H. Chen, I.A. Laird-Offringa, and C.G. Hoogstraten, RNA, 2008, 14, 1632-1643.
11. A.M. Kawasaki, et al., Journal of Medicinal Chemistry, 1993, 36, 831-841.
12. S.K. Alahari, et al., J Pharmacol Exp Ther, 1998, 286, 419-428.
13. D.R. Corey, J Clin Invest., 2007, 117, 3615-3622.
14. C.R. Allerson, et al., Journal of Medicinal Chemistry, 2005, 48, 901-904.
15. A.D. Keefe, and S.T. Cload, Current Opinion in Chemical Biology, 2008, 12, 448-456.
16. S. Davis, et al., Nucleic Acids Res., 2009, 37, 70-77.