每chip可同时检测6个样本，每个样本分析超过45200个转录子，基因信息来自于NCBI RefSeq database（Build 36.2，Release 22）以及RIKEN FANTOM2
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humanhap550+包含humanhap550相同内容的基础上，研究人员可根据自己的需要加入最多120600个SNPs。
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全基因组SNP分型研究、针对性SNP分型研究、连锁分析、拷贝数变化和杂合性缺失研究、甲基化研究、Beckman 基因分型系统、ABI荧光定PCR分型。
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HumanHap550覆盖了来自Hapmap计划项目（www.hapmap.org）>555k个全基因组标签SNP，覆盖了多类人群的全基因组信息。 另外，它还包含了约4300个新近报道的CNV区域的
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