宏基因组测序是对环境样品、肠道样品中的微生物群落的基因组进行高通量测序，主要研究微生物种群结构、基因功能活性、微生物之间的相互协作关系以及微生物与环境之间的关系。
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利用MALDI-TOF/TOF技术对双向电泳中指定的胶点（考染、银染或DIGE）或单一纯化蛋白样品进行质谱鉴定。
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实时荧光定量PCR（qPCR）技术，是指在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号积累实时检测整个PCR 进程，通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法 。这一技术可以用于基因表达谱芯片实验后的数据验证以及中、低通量的基因表达研究，miRNA的相关研究。
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基因组学是对真菌生长的遗传机制的全面理解，根据不同真菌物种特点，通过结合第二、三代对真菌进行基因组测序，可以快速而低成本的达到接近完成图和完成图的标准。
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可对高通量测序结果进行进一步的生物信息学分析，包括基因组、转录组、small RNA等测序后分析
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