华西&协和研究人员都在做的分析——拟时序
作者:上海吉凯基因医学科技股份有限公司 2023-03-21T15:03 (访问量:9414)
在细胞发育及分化等过程的单细胞研究中,同一时间捕获的细胞有些是分化后期的细胞,有些是分化早期的细胞。当我们想要了解在细胞从一种状态转换到另一种状态时所发生的调节更改的顺序时,我们可以进行拟时序分析(pseudotime analysis)。通过计算细胞间基因表达量的渐变关系,利用算法预测所有细胞在一条或多条虚拟的时间线上的先后顺序,构建出细胞的发育或分化轨迹。通过分析基因的表达特征,可以揭示随时间变化在发育或分化节点起关键作用的核心基因。
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