科研服务 | II型糖尿病circRNA Biomarker研究新成果

       研究背景

糖尿病（Diabetes）已经成为世界上继肿瘤、心脑血管病之后第三位严重危害人类健康的慢性疾病。全世界的糖尿病发病率，依然有逐年增高的趋势。II型糖尿病原名叫成人发病型糖尿病，占糖尿病患者90%以上。

郑州大学附属河南省人民医院李牧蔚教授课题组的赵振舟和李雪洁等研究者，采用博奥晶典人类环状RNA芯片 v2筛选II型糖尿病病人外周血中表达明显升高的circRNA，并研究了circRNA作为前糖尿病和II型糖尿病的诊断标记物的灵敏度和特异性，为II型糖尿病的诊断和治疗提供了新的思路。

技术路线

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主要结果展示

1. 博奥晶典人类环状RNA芯片v2高通量筛选circRNA

研究者选择了临床和统计学特征相匹配的6个对照组个体和6个糖尿病组患者，用博奥晶典人类环状RNA芯片v2对外周血中的circRNA表达分析，结果共找到489个circRNA在糖尿病患者和对照组个体之间存在明显的表达差异，其中78个circRNA在糖尿病患者外周血中表达上调，411个表达下调。

2. qPCR验证芯片结果

按FC＞2.4，p＜0.01筛选共得到5条circRNA，本研究在另外一个独立队列（对照组, n=20; 糖尿病前期group, n=20; Ⅱ型糖尿病组, n=20）中通过qPCR对其进行了验证，hsa_circ_0139110和hsa_circ_0018508在三个组中的表达量无明显差异，hsa_circ_0124636在前糖尿病和糖尿病组表达无差异，但均高于对照组，hsa_circ_0054633和hsa_circ_0068087在三组间表达存在统计学差异，且在对照组，前糖尿病组，T2DM组中的表达量依次增高。

3. 差异表达circRNA的ROC分析

为了分析两种circRNA的对前糖尿病及Ⅱ型糖尿病的诊断价值，研究者分别对其进行了ROC分析，结果hsa_circ_0054633在诊断糖尿病危险增高以及II型糖尿病时的AUC分别为：0.747（95%CI=[0.589-0.906],p=0.007 ）, 0.720（95%CI =[0.562-0.878],p=0.017 ）.hsa_circ_0068087在诊断糖尿病危险增高以及Ⅱ型糖尿病时的AUC分别为：0.692（95%CI =[0.529-0.856],p=0.037），0.717（95%CI = [0.557-0.878], p =0.019）。考虑到hsa_circ_0054633和hsa_circ_0068087相比拥有更大的AUC和更小的P值，因此选择hsa_circ_0054633作为诊断前糖尿病和Ⅱ型糖尿病的biomarker。

4.扩大临床样本验证circRNA biomarker

为了检验所筛选出的biomarker的临床诊断能力，研究者在更大的队列（对照组, n=60; 糖尿病前期组, n=63; 糖尿病组, n=64）中对hsa_circ_0054633进行了检测，结果发现hsa_circ_0054633在对照组，糖尿病前期组，Ⅱ型糖尿病组中表达量依次升高，作为biomarker在诊断糖尿病危险增高以及II型糖尿病时AUC分别为：0.751（95%CI=[0.666-0.835],P＜0.001), 0.793 ( 95%CI=[0.716-0.871], p＜0.001), 将吸烟，高血压，BMI，TC，TG，HDL，LDL等糖尿病危险因素加入之后AUC分别提升至: 0.841，0.834。

小编说

由于糖尿病早期空腹血糖受损和糖耐量异常阶段没有明显的临床症状，所以糖尿病的早期诊断显得非常困难，病人往往出现明显的临床症状或严重并发症（如肾衰、心血管并发症、视网膜病变等）才进行诊治，这给病人的治疗造成了不可逆转的延误。

近期的明星RNA分子，circRNAs已被证实参与了多种疾病的病理过程，但是II型糖尿病患者外周血中circRNA的表达特点，以及是否存在可用于诊断糖尿病前期和II型糖尿病biomarker的circRNA，目前尚无研究；本研究通过前期高通量circRNA芯片筛选和后续大量临床样本的有力验证，确定hsa_circ_0054633有临床潜力，可作为II型糖尿病诊断的biomarker。本研究选出的circRNA biomarker，具有取材方便，费用低廉，有较高的诊断价值和方便、快捷的诊断流程等优点。

参考文献

Zhao Z, Li X, Jian D, etal. Hsa_circ_0054633 in peripheral blood can be used as a diagnosticbiomarker of pre-diabetes and type 2 diabetes mellitus [J]. Acta Diabetologica,2016: 1-9.（IF=3.008）

博奥晶典人类环状RNA芯片v2

为了能够帮助广大科研工作者对circRNA进行更好地研究，北京博奥晶典生物技术有限公司在博奥晶典人类环状RNA芯片v1的基础上全新升级为v2。该芯片为目前国内、国外市场circRNA检测数量最多的芯片，便于研究者对不同生理和病理状态下circRNA的表达变化进行系统的研究，如进行疾病 biomarker 研究、功能研究、与 mRNA、miRNA 相互作用研究等。

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芯片特点

• circRNA数量多 芯片全面覆盖Circbase，Deepbase等数据库，检测circRNA数量达到170,340种，是国内和国外市场上检测数量最多的芯片。

• 探针的特异性强 芯片探针覆盖circRNA反向剪切位点，特异性高。一般情况下，该位点的序列不存在于基因组DNA和线性RNA分子中。

• 芯片检测效率高 芯片探针的靶向检测与二代测序的随机测序相比具有更高的检测效率。一次芯片实验检测circRNA数量远高于常规转录组测序（5-10G数据量）。

• 芯片的准确性好 芯片开发过程中的测试结果表明，高达74%的差异circRNA能得到定量PCR验证支持。

博奥晶典circRNA芯片系列

博奥晶典circRNA科研服务，不仅提供芯片检测服务，也提供circRNA-Seq检测服务。

产品咨询

bioservice@capitalbiotech.com

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博奥晶典科研服务事业部 李青、吴洁、张西轩 | 文案

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