湘雅三院:鉴定急性损伤皮肤的miRNA表达谱-技术前沿-资讯-生物在线

湘雅三院:鉴定急性损伤皮肤的miRNA表达谱

作者:联川生物技术公司 2015-03-25T15:37 (访问量:3508)

近日来自中南大学附属湘雅三院钱立元教授领衔的课题组对遭受皮肤急性损伤患者的瘢痕和正常皮肤的microRNAs(miRNAs)表达谱进行了比较分析。本课题招募了9例在2012年12月至2013年3月期间遭受皮肤急性损伤并接受手术治疗的患者。在手术过程中采集了来自同一患者的增生性瘢痕和正常皮肤区域的标本。为筛选差异表达的miRNAs,研究人员使用miRNA芯片对样品进行筛查,并采用了3种统计学方法,即传统t检验,错误发现率(FDR),和一种新的基于距离相关的确定独立筛选程序(DC-SIS)进行分析。研究人员进一步对芯片鉴定出的差异表达miRNAs的靶基因,进行功能趋势和代谢以及调节通路分析,并使用Ingenuity Pathway Analysis(IPA)对这些差异miRNAs在瘢痕愈合过程中的相互作用进行了分析。
DC-SIS鉴定出18个差异表达的miRNAs,其中4个(miR-149,miR-203a,miR-222,miR-122)也被FDR鉴定出。这4个miRNAs的靶基因具有多种生物学功能,并参与多种通路,如促分裂原活化蛋白激酶,Wnt信号通路,和焦点粘连。研究人员也鉴定出1个网络,18个差异表达的miRNAs中有14个参与其中。许多该网络中的miRNAs靶基因参与细胞增殖和凋亡。
在此项研究中,研究人员在患者急性损伤皮肤中鉴定出多个差异表达miRNAs。还需要对这些miRNAs做进一步研究来验证上述发现,并探讨它们在皮肤伤口愈合过程中的作用。


本研究中使用的microRNA芯片检测由联川生物承担完成

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