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5''-RACE, 3''-RACE

作者:上海捷兰生物技术有限公司 2008-10-26T00:00 (访问量:4545)

★ 可以高灵敏度、高特异性地扩增稀有RNA样品或低丰度基因

★  在通过杂交、cDNA文库构建等方法筛选到一段非全长的cDNA序列后,我们可以通过RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends) 实验进一步扩增此cDNA的5′末端或3′末端,从而得到全长的cDNA。

服务内容:

◇ Total RNA提取
使用AB公司TRIZOL,从各种材料中提取高质量的Total RNA。

◇ 3′RACE
使用TaKaRa 3′ -Full RACE Core Set Ver.2.0 (Code: D314) 进行3′RACE,试剂盒中独特设计的Adaptor和Nested PCR提高了PCR的特异性和灵敏度,从而轻松获得cDNA 3′端的序列。

◇ 5′RACE
使用TaKaRa 5′ RACE Kit ( Code: D315) 进行5′ RACE,试剂盒中的Tobacco Acid Pyrophosphatase能有效识别mRNA 5′ 末端的帽子位点,从而保证得到cDNA 5′ 端全长序列。

服务说明:

1. 样品:请尽量提供目的基因表达量高的单一样品。
1) 提取Total RNA的材料要新鲜,请您采样后立即放入液氮中速冻或加入样品稳定剂(如SampleProtector)。
2) Total RNA无降解,OD260/280=1.8 ~ 2.0。
3) 请提供尽量多的实验材料:3′ RACE Total RNA>15 μg;5′RACE Total RNA>25 μg。如果基因的含量较低或者未知序列较长,样品量需相应增加。

2. 已知序列:
1) 请提供大于200 bp的已知序列(请注明已知序列的5′ 端及3′端);如果已知序列比较短,建议先进行3′ RACE再进行5′ RACE,以提高实验的成功率。
2) 如果您有实验数据和参考文献等,也请发送给我们,这将会帮助我们更好地理解您的实验背景,有利于实验的顺利进行。
3) 我们会根据已知序列进行特异性扩增,如果得不到目的序列或为非目的基因的序列,我们将停止实验并收取实验成本费用。如果得到序列与您提供的序列有个别碱基不符,我们在征求您的意见后决定是否进行RACE实验。

4) 经验证,样品中基因含量低时,我们将与您沟通后,决定下一步实验使用的方法。
3. 由于mRNA存在个体和组织差异或基因的序列特殊,RACE的PCR产物测序有时会有个别碱基是套峰或测不通的情况,对未测通部分可继续进行克隆测序,最终提供两个质粒的测序结果,碱基的准确性由您自行判断。
4. 如果您的样品为原核生物,我们不保证调取的序列为3′ 和5′端全长序列。

注:

1. 对于样品中含量低的基因,我们可以使用特殊方法进行5′ RACE,请询价。
2. 如果根据已知序列进行特异性扩增,得不到目的序列或为非目的基因的序列,将收取500 元/样品的验证费用,Total RNA提取费用正常收取。
3. 如果RACE实验失败,将收取800 元/样品的RACE费用,Total RNA提取费用正常收取。
4. 实验周期指RACE扩增长度为基础长度时所需的时间;样品特殊、样品个数多和使用特殊方法时,实验周期顺延。

提供结果:

实验报告(包括PCR产物照片、测序结果等)、测序彩色波形图、测序方向图、碱基序列图、引物,如果产生克隆测序将提供测序用的质粒。

 

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