GO功能富集差异
KEGG通路富集差异
KEGG通路富集的分析可以帮助科研用户进一步了解差异蛋白质/磷酸化蛋白质富集在哪些通路上，以便找到最受影响的通路。分析结果呈现方式与GO功能富集方式类似，因此此处不另外展示。
Venn分析
针对两组学筛选到的差异蛋白进行Venn分析，直观地展示两组学同时定量到的差异蛋白数量以及各组学特异性定量到的差异蛋白数量，并对Venn结果进行GO/KEGG通路富集分析。分析结果呈现方式与前述Venn分析、GO/KEGG富集方式类似，因此此处不另外展示。
（3）去本底联合结果展示：新增4项
引起磷酸化修饰水平变化的原因主要有两种：1)蛋白质表达量发生改变；2）磷酸化反应调节机制的作用(如上游激酶活性发生改变）。考虑到激酶/磷酸酶介导的磷酸化调节机制受到广大研究者关注，且在高水平的Cell期刊上一项关于人类结肠癌的蛋白基因组分析中，研究人员最终选择的是癌症相关的磷酸位点时，不仅考虑了磷酸化差异倍数，还考虑了蛋白表达本底。因此，此版联合分析我们保留了去本底联合分析内容。
除此之外，我们也考虑到高水平联合文献中还通常涉及激酶靶点的筛选。因此，新版联合分析报告在保留了激酶-底物相互作用网络分析的基础上，新增了以激酶为核心的4项内容：
激酶-底物关系表
在保留原表中差异磷酸化位置、变化倍数、上游激酶预测结果等信息的基础上，增加了预测激酶在蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学中的表达变化情况（FC、P值）。
激酶-底物数量统计
激酶-底物和弦图
激酶活性预测分析
三大高级服务
从癌症到炎症性疾病、糖尿病、传染病、心血管疾病等多种疾病的发生均与蛋白质磷酸化的异常存在关联性。这也意味着蛋白激酶/磷酸酶可以成为多种疾病的药物靶点。随着MAPK、JAK 及PI3K等信号通路研究的发展，激酶作用机制以及对激酶抑制剂的研究也逐渐成为了新药研究的热点，尤其是在癌症治疗中是最有吸引力的治疗靶点之一。
为了助力广大科研工作者对激酶结构特征、作用机制和对激酶抑制剂做进一步研究，我们将提供三大高级服务（收费内容）：
（1）人激酶树注释
（2）激酶抑制剂/药物注释
基于目前生命科学研究领域最可靠、最全面的功能研究数据库—Ingenuity Pathway Analysis（IPA数据库）注释靶向激酶的抑制剂&药物注释服务。
（3）吉凯激酶病毒产品
吉凯基因拥有20年专业病毒生产经验，已提供过200多种定制的激酶病毒产品，可满足研究者对激酶敲减、过表达等操作的研究需求。
以上为本次新版联合分析报告的最主要的升级看点和内容。我们衷心的希望2022版联合报告能够助力科研用户轻松走完“科研的最后一公里“。自2022年4月25日起，尚未进入生信分析的老合同（项目进展可查看吉凯推送的项目进展邮件）和新签的蛋白质组+磷酸化蛋白质组联合项目，即可享受全新升级分析，加量不加价！欢迎订购吉凯基因蛋白质组+磷酸化蛋白质组产品及联合分析，以及推荐给身边正需要的朋友！
吉凯基因凭借多年在靶标筛选及验证服务领域的技术积累，建立的标准化 、工程化 、系统化的GRP平台，为中国研究型医生提供科研服务，加快科研成果转化。其中，多组学平台包含蛋白质组学平台和单细胞测序平台：
·蛋白质组学平台拥有多台timsTOF Pro、Exploris 480高精度质谱仪，专业的Spectronaut Plusar、Mascot等分析软件，提供专业的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修饰组和Olink蛋白质组等检测服务，强大的机器学习算法、IPA分析、蛋白基因组分析服务，系统的生物标志物、分子分型、药物靶点、基因功能研究等解决方案，真正让广大研究型医生的科研工作更省心、更省力、更高效；
·单细胞测序拥有10x和BD两个平台，提供单细胞RNA-seq、单细胞核测序、单细胞混样RNA-seq、单细胞（RNA+ATAC）、空间转录组测序等服务。 ,
近年来，蛋白质组+磷酸化蛋白质组联合表现出强劲的增长势头。在Pubmed上不管是磷酸化蛋白质组，还是蛋白质组+磷酸化蛋白质组联合的文章数量都在持续增加，且上升的趋势同步。这也表明越来越多的研究者关注磷酸化的同时，也同时关注蛋白质组学水平的变化。Letpub数据显示2021年国家自然基金批准的磷酸化研究突破了300项，总资助金额超过1.4亿，其增长趋势与文献数增长趋势也一致。蛋白质组研究的是蛋白表达变化，磷酸化蛋白质组研究的是蛋白的磷酸化修饰变化。两组学联合能解释蛋白不同层面的信息，互为补充，为识别研究课题相关的磷酸化事件、关键信号通路和调控机制提供了一个全面的视角，有助于发现疾病靶点和生物标志物，辅助疾病的诊断与治疗。
吉凯基因一直致力于提供专业的蛋白质组学服务，本次我们对蛋白质组+磷酸化蛋白质组联合分析（以下简称联合分析）进行了全面升级！产品详情可点击查看4.20日线上发布会视频。
简单来说，此次我们基于创新药物靶点的科研与转化需求以及高水平文章的生信分析内容进行了产品升级，新版报告具有4大核心看点，新增14项生信分析（累计基础分析近30项）和3大高级服务，丰富度超过大多数同行！自2022年4月25日起，尚未进入生信分析的老合同（项目进展可查看吉凯推送的项目进展邮件）和新签的蛋白质组+磷酸化蛋白质组联合项目，即可享受全新升级分析，加量不加价！
新版联合分析报告升级成网页版，界面干净、整洁。右侧目录栏帮助科研用户快速知晓报告的主体内容，点击主目录可展开其子目录，支持科研用户随心所欲切换到感兴趣的条目上。新版报告内嵌了多重交互式体验，比如增加浮动显示窗，隐藏或展开分析结果，点击下拉按钮可切换分析结果以及网络图中的蛋白可任意拖动，让整个报告更加人性化、个性化。
干净整洁的报告界面
交互式的报告设计
2. 全面升级的生信分析：近30项基础分析+3大高级服务
新版联合分析报告包含3大分析模块，对应从基础到复杂的生信数据分析需求，帮助科研用户由浅入深，循序渐进理解组学结果。此次新增venn、PCA、相关性分析、激酶-底物和弦图以及激酶活性等14项分析，累计基础分析达27项之多。同时为满足科研用户对激酶功能的深度科研需求，提供激酶树、激酶抑制剂&药物注释服务和定制病毒等三大高级服务。
新版联合分析基础内容
3. 详细的文献注释和图表解释：让每一项分析都读得懂，有据可依
新版联合分析报告涉及高水平文献37篇，让整篇报告都有据可依。同时每一项分析都有明确的图表说明和解释，帮助科研用户更好的理解和使用分析结果。
部分报告内容示例
4. 新增论文框架和投稿建议：想客户所想，让科研更轻松一点
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