上新 | 5min甲基化超快速BS转化试剂盒,新增磁珠法!-技术前沿-资讯-生物在线

上新 | 5min甲基化超快速BS转化试剂盒,新增磁珠法!

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2025-01-10T00:00 (访问量:1999)

随着分子检测的不断发展,甲基化qPCR检测以及甲基化NGS检测已成为非常普及的检测技术,这两种技术的必经之路就是甲基化转化,甲基化转化从方法学上可分为亚硫酸氢盐转化和酶法转化,近几年,基于DNA甲基化位点的检测试剂盒陆续获批面世。NMPA批准的甲基化检测试剂盒大部分为荧光PCR法,主要原因在于荧光PCR法操作简便,无需在PCR后电泳,且具有灵敏度高、特异性强、重复性好等特点。这些甲基化检测试剂采用的转化方法为亚硫酸氢盐转化法,亚硫酸氢盐转化成为DNA甲基化检测的“金标准”。但是传统的亚硫酸氢盐转化有很多局限性,例如过长的转化时间、严重的DNA损伤、被高估的5mC水平、C-U转化不完全等。

图1.亚硫酸氢盐催化C转化为U的化学反应概要

 

2024年1月2日,芝加哥大学何川教授团队Nature Biotechnology上在线发表了题为Ultrafast bisulfite sequencing detection of 5methylcytosine in DNA and RNA的研究论文,该研究提出并开发了对DNA和RNA上的5-甲基胞嘧啶修饰进行快速,准确检测的测序方法,简称为UBS-seq。该技术比现有的转化反应过程加速20-30倍,同时明显的降低了DNA损伤,以及C-U转化不彻底导致的背景干扰。

图2.UBS-seq法在微量样本中应用,传统BS转化相比有更低的背景噪音

 

翌圣生物的Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit(柱式:12225ES)和Hieff® Mag Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit(磁珠法:12227ES)便是基于此技术开发优化而成,可以在98°C 5min条件下可完成>99.5%的胞嘧啶转化,并且极大的降低了DNA损伤,更好的保证了DNA片段的完整性,约35 min可完成BS转化全流程,转化后的产物适用于PCR扩增和DNA测序等下游应用。

 

 

实验流程

图3.Superfast BS转化实验流程

 

   

产品亮点1

优异的转化率

投入不同量的293gDNA,293gDNA参入0.5% λ DNA,使用12227(磁珠法)与竞品1转化试剂盒进行头对头对比,同时采用双链甲基化DNA建库(12214ES),如图4所示:12227(磁珠法)对不同投入量的DNA中 λ DNA C的转化率≥99.5%,转化时间适当延长,能进一步提高转化效率。

图4.12227和竞品的转化率

 

   

产品亮点2

优异的样本兼容率

10 ng cf DNA和50 ng FFPE DNA,cf DNA和FFPE DNA都参入0.5% λ DNA,使用12227(磁珠法)与竞品1转化试剂盒进行头对头对比,同时采用双链甲基化DNA建库(12214ES),如图5所示:12227(磁珠法)对不同样本中 λ DNA C的转化率≥99.5%,转化时间适当延长,能进一步提高转化效率。

 

   

产品亮点3

优异的回收率

投入不同量的293 DNA,使用12225和12227与竞品1转化试剂盒进行头对头对比,转化后采用Qubit ssDNA定量,计算回收率,如图6所示:12225的样本回收率能稳定达到60%以上,并且当样本量大于200 ng,回收率能超过70%,磁珠法转化试剂在高投入量下,回收率略低于柱式法,1 μg以内,磁珠法的回收率能达到60%。

 

   

产品亮点4

适用于单细胞甲基化建库

在微流控的自动化单细胞DNA甲基化平台上,进行单细胞甲基化转化实验,样本中单细胞DNA转化率在99%左右。

 

 

产品推荐

 

产品名称

产品货号

Hieff® Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit超快速DNA亚硫酸氢盐转化试剂盒(柱式)

12225ES

Hieff® Mag Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit超快速DNA亚硫酸氢盐转化试剂盒(磁珠法)

12227ES

 

 

翌圣DNA甲基化解决方案

 

 

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